妊娠期间甲亢的病因与非妊娠期间甲亢的病因基本相同，其中以graves病最为常见。其次是毒性结节性甲状腺肿、甲状腺自主性高功能腺瘤等。另外，妊娠剧吐、葡萄胎、恶性葡萄胎和绒毛膜上皮癌均可出现甲亢。妊娠期的病理性甲亢极为少见，发病率极低，即便是孕前就患有甲亢，也往往在怀孕后因免疫活性降低而自行缓解或减轻。
不同病因所致甲亢有不同病理生理改变。
1.弥漫性毒性甲状腺肿 也称graves病，是一种自身免疫性疾病占甲亢患者的60%～70%，容易发生在有遗传上易感的个体。生育年龄的妇女发病率高。很多妇女是在妊娠前诊断的，以后进入妊娠;也有一部分孕妇，过去有弥漫性毒性甲状腺肿，经治疗基本痊愈或已经完全痊愈后妊娠此类患者多有突眼，故也称恶性突眼性甲状腺肿，这类甲亢妇女妊娠期常需要药物控制病情。此类患者体内存在一种免疫球蛋白抗体，也称甲状腺刺激免疫球蛋白(tsig或tsab)，过去称为长效甲状腺刺激素(lats)可以通过胎盘，它可以引起胎儿和新生儿甲状腺增大和甲亢。在graves病和桥本病患者中还存在tsh阻断抗体(tsbab)，当tsbab为主时graves病可以出现甲减(kenneth，1998)，抗体作用于甲状腺上tsh的受体，通过激活三磷腺苷酶加强碘的摄取，引起甲状腺过多的合成t4和t3，使患者发生甲亢。当tsbab通过胎盘时，可以造成胎儿和新生儿甲减，甲状腺不肿大。trab的刺激和阻断抗体不能分开预测(gallagher，2001)。graves病孕妇体内的tsi、trab为免疫球蛋白igg分子小，容易通过胎盘，在宫内刺激胎儿的甲状腺目前可以测定母亲trab，如果tsab(tsi)滴度相当高，足以引起胎儿产生高水平的t4、t3时，那么胎儿在宫内可能发生甲亢。相反，如果tsab阻断抗体tsbab占优势胎儿也可能发生甲减。
2.慢性淋巴细胞性甲状腺炎 也称桥本氏甲状腺炎，是一种自身免疫性甲状腺炎患者体内有甲状腺自身抗体，包括甲状腺球蛋白抗体(tgab)和甲状腺过氧化物酶抗体(tpo-ab)。甲状腺组织学特征是淋巴细胞浸润，结缔组织形成和腺上皮改变甲状腺增大、质韧、不规则。早期表现甲亢，然后进入甲低，部分患者在代谢亢进时容易误诊为毒性甲状腺肿，因而切除部分甲状腺，病理确诊为淋巴细胞性甲状腺炎待病情后期需要补充甲状腺片。
3.毒性结节性甲状腺肿及毒性甲状腺腺瘤 在世界上很多缺碘地区，该地区妇女甲状腺可发生单发或多发结节，甲状腺代偿性增生。单发或多发结节性甲状腺肿可以发展成甲状腺毒症，而出现甲亢。缺碘所引起的甲状腺肿或腺瘤，可以进行外源性补充碘治疗而使病情缓解如果由于单个的甲状腺腺瘤有功能亢进也可以考虑手术切除。孕妇合并毒性多发结节性甲状腺肿少见多数孕妇如需手术治疗，尽量延缓到产后进行。
4.滋养细胞疾病 如葡萄胎和绒毛膜上皮癌这些病人血清内β-hcg水平很高，对甲状腺刺激作用血清tt4值可较正常人升高1倍临床上可以出现甲亢。当葡萄胎被刮宫清除后，绒毛膜上皮癌手术治愈后血清β-hcg水平降低，血清中tt4下降甲亢症状也自然消失。